北宜高雪山隧道還沒通車，現在又引發宜蘭和台北縣坪林一帶的缺水問題，當地農民叫苦連天，甚至還有魚塭因為水量變少，乾脆把魚塭改成菜園，國工局出面表示，開挖雪山隧道確實影響地下水的儲水，但主要原因是大自然的變遷，不過國工局也會協助當地民眾改善供水系統。
這片農田，距離雪山隧道不到5百公尺，以前農民全部都是引地下水灌溉，現在卻因為天然湧泉消失，只能靠抽水機抽水，不僅如此，就連魚塭都因為沒水，被迫改成菜園，農民叫苦連天。
農民：「以前（雪山）隧道還沒好之前，我們都直接引用（地下水）用。」記者：「現在呢？」農民：「現在沒辦法了，連洗手都沒水。」
農民：「現在如果要灌溉都要從那邊（抽水機）抽水，從魚池抽水才有水。」
農民怨，雪山隧道施工後，不僅造成生態改變，連長時間累積的地下水也付諸東流，但國工局有話要說。國工局山區工程處長張文城：「大自然影響才最關鍵，我不能說雪山隧道沒有影響，但對整個農業的生產，或是老百姓的地下湧水也好，或水井也好真正影響，最關鍵的還是整個大自然的氣候，才是最關鍵的。」
宜蘭地區，在雪山隧道施工前，1年大約可以儲存1千萬公噸的地下水，但施工後，卻造成缺水問題，現在怎麼辦？張文城：「這些地下水，目前我們規劃2個，第1個是比較乾淨的水，可能會提供給自來水公司，（自來水公司）剩下的水，會當作灌慨用水，這個已經跟宜蘭區的農田水利會協議談好了。」
雖然無法肯定湧泉變小和雪山隧道的開挖有關係，但缺水是事實，國工處表示，會盡可能改善供水系統，不過蓋1條3百億的隧道，是否已經改變了自然生態，農田的缺水問題，可能只是個警訊。
