憲兵搜索機密文件的風波沸沸揚揚，行政院長張善政親自召開記者會，他說出重話，認為國防部應該把知情的主管立即調離現職。張善政表示，是由政戰局及憲兵指揮部的決策，為了未來能讓調查順利，認為國防部應該把相關主管調離現職，由於這個案子不單純是部隊裡的案子，還涉及民間，若由憲兵部隊處理將會有疑慮，較理想的做法，應是交由檢察官體系處理。
