台北市為了第12期40萬劑疫苗，跟中央槓上，因為中央指台北市的量能是六都最低，陳時中一天內兩度噹台北市要多努力，有問題要事先講，不過柯文哲認為問題出在溝通不良，再反擊中央疫苗規劃不平均，是在找麻煩。
一天被陳時中噹了兩次，中央塞40萬個疫苗名額，台北市喊吃不消，柯文哲說是有溝沒通，陳時中回，哪是這樣。
衛福部長陳時中：「如果真的是做不來，那我們再跟他們講相關的一個，供應量的時候就應該提出來，因為這不是事後才來講，是事前就已經大家報。」
認為中央要拚疫苗覆蓋率，不顧地方醫療量能分配，但為何別人可以配合，台北卻不行。
台北市議員(國)徐巧芯vs.市長柯文哲：「人家新北做得到，台中做不到，台北做不到的時候就會被提出來檢討，如果疫情不是很緊急，他應該把它(疫苗名額)拉平，第一個禮拜40(萬)，第二個禮拜18(萬)，給大家找麻煩，你為什麼不乾脆30(萬)30(萬)就好了。」
柯文哲為自己辯駁，但議員再爆料，中央加開五個地點，幫台北市施打4萬多劑BNT疫苗，支援的三總跟北榮，北市叫不動。
台北市議員(國)游淑慧vs.衛生局長黃世傑：「這一次的調查居然是，三總拒絕台北市政府嗎，我們有叫他開，但是他就是沒有辦法增加這個，也不是拒絕，但是我們要求他就是做不出來。」
台北市議員(國)游淑慧vs.市長柯文哲：「(中央)有點在給你設陷阱穿小鞋，每個醫院一直在抱怨，他說我準備這麼多，你打這麼多，每次都浪費我們那人(力)，醫療體系叫他動員，他還是會動員。」
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