前中研院長李遠哲接受日本媒體專訪，明確表達對謝長廷的期待，讓外界解讀為表態挺謝，對此李遠哲做了進一步說明，說他從來沒公開說過要支持誰；事實上，5天前，李遠哲接受TVBS獨家專訪，就已經定調大選前不再表態，轉而提出「制衡」觀點看待這回的總統大選，還客觀表示，馬謝的政見他都要好好看一看。
李遠哲接受日本產經新聞專訪時，公開表示，期待謝長廷能夠當選總統，不過事隔一天，李遠哲的態度似乎有了轉彎，強調自己從來沒說過支持誰，心裡話也不用公開講，2個月後就會知道，這樣的態度，其實早在5天前接受TVBS專訪時，已經定了調。
前中研院院長李遠哲：「民主社會制衡很重要，制衡很重要，現在立法院在野黨，現在的民進黨，已經不能沒有制衡的力量，剩1/3都不到，制衡的力量沒有了，就很多人說，這樣子的話，總統應該是讓民進黨來做，會比較好嗎？這是有很多人的想法。」
侃侃而談，只提制衡，到底挺誰，李遠哲絕口不提。李遠哲：「老百姓要看的是，這兩個總統候選人，哪一個能代表大多數的利益，這將會是很重要的。」主持人李四端：「你還是沒告訴我們，您的選擇是什麼。」李遠哲：「因為我還沒聽到他們兩個的政見，我還要仔細的來看。」
不再提前表態，換個方式，主張以制衡的觀點來看待總統大選，李遠哲以相對客觀代替絕對主觀，不願再重蹈2千年的覆轍。
