普悠瑪重大出軌事件正緊鑼密鼓調查中，肇禍原因眾說紛紜，除了列車自動保護系統(ATP)可能被關閉之外，台鐵最新表示，事發前半小時，司機曾經陸續回報氣壓不足，導致煞車出問題。不管原因為何，不少專家呼籲，台鐵應仿照飛安會，成立第三方超然獨立調查小組，因為由台鐵內部的保安會調查，難逃球員兼裁判之嫌。
TVBS記者戴元利：「普悠瑪列車上所使用的ATP，其實就等同於高鐵所使用的，ATC自動控制系統，像是我們在畫面的左方可以看到，不管是直線或彎道都會有一道速度碼，如果駕駛車開得太快，系統就會自動降速來確保行車安全。」
遊戲模擬怎麼開高鐵，透過電腦監控、輔助駕駛，有些路段時速從70、80公里慢慢往上加，過彎也有降速示警，
鐵道暨國土規劃學會常務監事任恆毅：「所謂的搖擺式列車的話，它其實是這樣，當車子在過彎的時候車子會傾斜，那它可能有一個氣墊在充氣，讓它傾斜角度再更大一點，越傾斜越好過彎，但是斜到某一個程度的時候，我們又有另外一個風險，就是我們可能會因為離心力的關係，就把它拋出去了。」
逢甲大學運輸與物流學系教授葉名山：「傾斜式列車它會產生一個，橫向的作用力出來，要比一般的車子它要來得大，所以路基要養得更好，就是道路它的那個處理，它的強度要夠，能夠抵抗它橫向的應力。」
2013年，基隆港將普悠瑪吊掛下船，嶄新的列車讓乘客來往花東有更多選擇，回顧2012年，台灣向日本引進普悠瑪，2013年正式營運，在鐵道迷心中，無論外型或性能，普悠瑪都有其指標意義。
《鐵道情報》雜誌總編輯古庭維：「在爬坡的一些控制上面，因為我們有在開車，你就知道有時候你爬陡坡的時候，油門踩得很猛，但是車不一定會上去，可能會打滑之類的，其實(普悠瑪)它是有一些控制的元件，去處理這樣子的事情，所以它的性能其實是還不錯。」
通過第三方驗證的普悠瑪，如今釀成台灣史上最嚴重出軌意外，除了調查ATP是否關閉，軌道是否有異物也亟待釐清，由於新馬站每天經過的普悠瑪多達20、30班，前一班車若發現軌道有問題，會往上級通報，出事前一天沒通報，列車卻突然出事，因此被懷疑，軌道異物釀禍不無可能。
針對這次普悠瑪事件，台鐵內部行車保安委員會已著手調查，不過鐵道專家呼籲，應該比照飛安會，成立超然獨立的第三方團體，才能對症下藥。
鐵道暨國土規劃學會常務監事 任恆毅：「不是說台鐵行保會不夠專業，但是球員兼裁判的疑慮永遠存在，那為什麼要這樣子呢，我們可以比照飛安會，我們可以比照國外的NTSB，類似運輸安全委員會，我們用一個更超然的一個監管機構，它可能甚至不是在交通部之下。」
專家也直指，軌道養護維運需要大量經費，但台鐵票價一路凍漲，勢必間接影響行車安全，悲劇過後，該如何改善制度、減少意外發生，每一步都是關鍵。
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