陳水扁無保釋放，特偵組兩度提出抗告，台北地方法院經過12個小時庭訊，凌晨裁定陳水扁收押，但不用禁止接見或通信。法官蔡守訓認為，陳水扁犯行重大，罪行高達無期徒刑，而且有串證和湮滅證據以及逃亡之虞，加上他過去審理吳淑珍的國務機要費，也曾經碰上困難，因此裁定羈押。
凌晨2點多合議庭裁定，應將被告陳水扁予以羈押，因為不羈押，可能會影響後續的審判進度。台北地方法院庭長黃俊明：「合議庭被告（陳水扁）有可能湮滅、變造證據，及勾串共犯或證人的行為，而且他所犯為最輕本刑7年以上的重罪，因此裁定羈押。」
合議庭法官認為，陳水扁涉嫌貪污、侵占和行賄、洗錢等等罪嫌，法定刑期高達無期徒刑；而且陳水扁曾經當過總統，權傾一時，具有相當影響力，加上扁家在海外還有5億7千萬，陳水扁也承認陳致中和黃睿靚知道資金流向，所以有逃亡之虞。
法官還引用特偵組提出的新事證，認定還有潛在的公務員，偷偷洩密資料給陳水扁，有滅證之虞。
另外，審判長蔡守訓，因為承審過吳淑珍國務機要費案的關係，長蔡守訓在庭訊尾聲，一連問了陳水扁十幾個問題，都是有關國務機要費案，還指出陳水扁一再攻擊司法，掩飾犯罪，把非機密卷證核定為絕對機密，但法官認為，陳水扁串證機率降低，只有羈押不須禁見。
黃俊明：「目前應該他不至於會有肆無忌憚的去串證，因此認為說沒有必要去禁見，但是以後如果發現有（串證）這種狀況，合議庭會有適當的處分。」
特偵組2度抗告終於成功，但開庭前，陳水扁的律師突然要求法官蔡守訓迴避審理，對此，北院表示，目前已經分案，但根據分案實施要點規定，只要有相牽連的案件，後案並前案符合規定，間接證實，這次裁定結果不受影響。
