台北市長柯文哲28日晚上在臉書發文，暗示黑衣人闖分局事件有內幕，所長可能背了黑鍋，而今天他情緒似乎也受到影響，上午出席信義區里長座談會時，原本不開放受訪，卻突然受訪。表示他認識的基層員警對工作都非常負責，一定要把事情都查清楚，才可以懲處，強調這幾年警紀崩壞，或許也跟人事升遷制度崩壞有關。
台北市長柯文哲：「出事情的時候，還是要查清楚再處分，就我認識的基層員警，絕大多數都是奉公守法，很認真在做事。」
情緒受到影響，然而前一天晚上，柯文哲就對於所長刪除關鍵監視器畫面在臉書發文，分析所長根本沒動機，意有所指是不是背了黑鍋。
柯P寫著，一個所長為什麼要湮滅證據，動機從哪裡來，是不是遭到其他壓力，這是不是警界長年來被詬病的吃案文化？還表示這幾年來警界士氣低落，某方面也跟人事升遷制度崩壞有關，賞罰不明升遷不公，自然警紀就會紊亂，最後主張勿枉勿縱。
事後上演的跟黑衣人握手言和戲碼，也被外界質疑是不是不想辦案，29日上午北市警局長陳嘉昌以及林志誠再度備詢。
前松山分局長林志誠：「那一天的相互之意，並不是說我們不辦，這個部分是我決定的，抱歉，我負責，因為他們說願意給我們同仁say hello，可是是他們兩個人自己相互之意，可是並沒有和解。」
台北市警察局長陳嘉昌：「事發當天所長是休假的，第二天來上班的時候，副所長有把概略的狀況，告訴所長，但是所長(對電腦)不是很熟，所以沒辦法馬上釐清事實的經過。」
一連串的羅生門引發爭議，也再度重挫了警界形象。
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