連假第二天，國道南下一早6點又湧現車潮，國5南港到石碇局部路段，再度出現「紫爆」。有學者批評，儘管有高乘載管制，以及深夜也實施暫停收費，但跟春節相比，清明連假簡直「塞爆」，交通部這次反應慢半拍，而部長賀陳旦，4日視察蘇花改時，還傳出他說如果私人行程，會走替代道路看山海風景，這番話又引發爭議。
但其他路段，國道三號中投至霧峰，還有新台五路到堤頂，一度出現紫爆，比平時行車時間多5倍，時速只有10公里，國道1號湖口到新竹，路況紅通通，時速只有10到30公里。有學者批評，儘管事前有宣導匝道高乘載管制、整合匝道、以及深夜也實施暫停收費，但跟春節相比，清明連假「塞爆」，交通部這次反應慢半拍。
逢甲大學運輸與物流系副教授李克聰：「交通部沒有預測到，這麼嚴重塞車下，所以在事前的減量，跟相關的分流宣導上面，就是我們提出預警措施上面，沒有做得徹底跟完整。」
交通部長賀陳旦(4月4日)：「比我想像中久，因為我本來應該是1個半鐘頭，但現在大概花了2小時20分鐘。」
視察蘇花改，交通部長也很有感，塞車比預期嚴重，傳出交通部長卻說，如果是私人行程，他會跟家人事先規劃，改走替代路線，體驗蘇花山海的美景，這番話又引起爭議。
高公局科長蔡明哲：「昨天因為車流量比較集中，而且昨天的車禍事故，是比平常跟去年同期增加快2倍。」
不只車禍事故釀成塞車加劇，高公局強調，7個地雷路段，包括上午湖口到新竹，彰化到鹽埔，鶯歌到關西等等，傍晚開始西螺至鹽埔、頭城至坪林盡量避開。因為預計6日開始，收假時還會再塞，尤其7日會達到塞車尖峰。
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