國家球員最常面臨的就是兵役問題，體委會最近研擬開放優秀的役男棒球球員，不用再以學生的名義出國，可以正式加入美國大聯盟等國外職棒的網羅，但附帶條件，就是必須接受徵召回來參加國際性比賽，如果在奧運或亞運打入前三名，兵役就能全免。
兵役問題一直困擾著體育選手，為了解決這個問題，體委會目前規定，面臨兵役的球員先在國訓隊培訓，必須集訓2年、列管1年；另外對於被國外球團網羅的優異選手，只要在奧運以及亞運能夠幫國家打出前三名，就能兵役全免。
這個5年的優惠辦法，原本是鎖定希望曹錦輝能夠回國打亞錦賽，沒想到，等不到曹錦輝，剛好王建民成了這個辦法的第一人。體委會競技處科長藍坤田︰「因為我們國內沒有適合的環境給他，因為他們的層度比較高，屬於特優級的選手，如果說我們能夠根據這個辦法，提5年的列管方式，讓他同意在國外繼續打比賽，但他在5年內接受我們徵召，回國比賽，對我們的亞奧運成績爭取有很大的幫助！」
除了旅外球員外，體委會也正積極推動職棒二軍，未來像是國訓隊裡表現優良的林岳平等人，將可以利用職棒二軍方式來代訓。體委會競技處科長藍坤田︰「請職棒協助我們代訓，另外一方面，希望我們職棒發展正常化，類似日本、美國一樣有二軍輪替，讓將來整個職棒發展更健全。」
體委會表示，為了網羅更多的優秀人才回台效力，已經打算把這項規定擴大到桌球、網球、跆拳道等等各種項目，體委會一方面希望幫國家網羅更多好手，回來效力，也希望讓選手有更好的環境繼續發展，當然，困擾以久兵役方案也得先幫忙解決。
