指揮中心先前拍板，確定國內6到11歲兒童可以從5月2日起施打半劑莫德納疫苗，不過陳時中昨日透露，台灣已經和BNT簽訂採購合約，最快在五月中有望迎來第一批兒童劑型的BNT疫苗，不少家長開始猶豫，到底要不要讓小朋友打，要打莫德納還是BNT？對此林口長庚兒科醫生吳昌騰表示，BNT在美國已經施打八百多萬劑次的兒童，安全性可以，至於莫德納雖然可能打了發燒比例比較高，但是吳昌騰表示，「我自己認為保護效果應該比較好」。
先前北市發出「兒童接種莫德納疫苗」同意書給家長，意願已經不到五成，現在殺出BNT恐怕又會影響接種率，甚至彰化傳出「抽單潮」，要接種莫德納的國小學童恐怕剩下不到兩成。吳昌騰表示，不建議抽單，因為國內疫情不斷升溫，先有一個保護力比較好，甚至其他人建議可以先打一劑觀察，這樣的建議也不錯。
吳昌騰認為，可能大家對BNT跟莫德納觀念會停留在成人使用的感覺，BNT在美國大概打了八百多萬劑次兒童使用經驗，莫德納則是最近才在歐洲跟英國實際使用，「但我個人覺得兩個都是不錯的，安全性也可以，只是家長可能認為莫德納就是一半的成人劑量，所以會比較擔心會不會有副作用產生。」但吳昌騰表示，「從文獻來看，BNT打了後以美國紐約統計，大概七到八週兩劑完成保護力僅12%」，所以以現在國內疫情目前逐步增加，我認為小朋友至少有疫苗先打，先有一個保護力比較好。
吳昌騰進一步說明，「美國5到11歲兒童有三之一小朋友接種BNT疫苗，打了後嚴重不良反應其實不多，心肌炎病例報告也僅有11、12例左右，也都有恢復，所以很多家長覺得劑量小、副作用相對低。」吳昌騰表示，BNT副作用的確低，「但保護力而言莫德納可能比BNT好」。至於莫德納研究，美國加拿大做了四千多位小朋友的研究，在二期三期實驗當中沒有發現心肌炎，不過也可能是施打人不夠多。不過安全性應該都是可以的，主要還是由家長評估，因為兩隻疫苗都是有完整的臨床實驗的。
至於小朋友打了疫苗常見副作用，其實和大人類似，包括輕微不良反應就是局部反應，這兩款疫苗包括，注射部位疼痛、發燒、頭痛，莫德納則是會有腸胃症狀，類似嘔吐等症狀，BNT則是發燒、注射部位疼痛，不過發燒莫德納相對比較多。至於嚴重不良反應，則是要觀察是否有過敏性休克，心肌炎、神經炎只有零星報告但個案並不多。
吳昌騰表示，建議指揮中心可以建立醫療尋求資源窗口，讓家長對於小朋友疫苗不良反應有地方可以諮詢，比如在哪個診所、醫院負責施打，可以有窗口讓家長詢問醫師，包括小朋友注射後的疫苗不良反應等等。家長也可以在家裡備好退燒藥，讓小朋友服用比較安心。
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