健保改革健保署擬調整急診、藥品、慢箋等部分負擔，其中慢箋部分負擔規劃，到醫學中心及區域醫院領取第二、三次慢箋，每次要多付100元，地區醫院、基層診所、社區藥局則免收。但卻引發大醫院不滿，認為收費應不分層級。藥師公會則表示，社區藥局若要收費是懲罰慢性病患。
國立陽明大學醫務管理研究所兼任副教授洪子仁：「如果我們現在只有設定在大型醫院有收藥品的部分負擔情況下，這就有可能造成就是說，是不是在診所或地區醫院或藥局，依舊(藥物)浪費。」
誰說只到大醫院領藥才會浪費，為平息爭議提出另兩個方案，方案一、地區醫院，也加入收費行列，方案二、社區藥局都要酌收慢箋費用，但這麼一來，藥局代表也覺得不妥。
藥師公會全國聯合會理事長黃金舜：「社區藥局藥師時間，會比大型醫院更多，在整個用藥的照顧，包括藥品的浪費，我們願意花時間指導民眾。」
若連社區藥局都收費，藥師公會認為，這是懲罰慢性病患，到底聽誰的，好棘手，陳時中28日下午也召集各醫界代表溝通協調，健保改革目的是讓，相對弱勢者就醫更方便，而過去不少癌症患者總在治療過程中嘗遍無效用藥，未來或許能透過次世代基因定序，提供有效的治療。
像安潔莉娜裘莉就因發基因缺陷，屬乳癌高風險群，進行預防手術降低罹病機會，目前健保署已委託，針對次世代基因定序估價，可望納入健保給付，也預計不限單一癌別。
國立陽明大學醫務管理研究所兼任副教授洪子仁：「次世代基因定序，5年前日本就已經把NGS(次世代基因定序)納入所謂他們健保的給付，對於癌症病人治療會有非常大幫助。」
2020年癌症健保，就醫就超過77.7萬人，支出1212億，預防勝於治療，國內肺癌治療權威楊泮池也提到，現行健保給付單一基因檢測，每做一個基因就給付一次，未來若能一次把多個致癌基因找到，也不會增加健保支出，建議初期從肺癌著手，預防勝於治療，但最終結果仍得等，部長討論後拍板。
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