指揮中心10月21日公布未來AZ疫苗可以混打BNT疫苗，但宣佈時間點就在第12輪AZ疫苗第二劑接種前夕，即日指揮中心指揮官陳時中稱並未出現想像中的打氣低迷，但遭台北市長柯文哲直言是「整死大家」，對此，陳時中今（23）於指揮中心記者會上表示，只是把可以做到的事跟大家宣布，「不要有這種錯誤的感覺。」
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柯文哲昨（22）表示，第一天開始打AZ，結果就公布說要混打，「不曉得是要整誰，到時候一堆人不來打，也不是取消，是直接爽約，下次再預約BNT」直言這樣是整死大家。陳時中今回應，只是把可以做到的事跟大家宣布，不要有這種錯誤的感覺。
另外，對於疫苗分配量，柯文哲也說，疫苗量一下高一下低，中央應該要事先講好，地方才能想辦法應付，這樣突然來，結果登記也沒那麼多，呼籲應該要坐下來討論。
對於柯文哲說想和中央一起討論，陳時中表示，目前還沒接到聯繫，如對施打上有任何混擾，都歡迎來討論，大門都是開著，想討論沒有問題。
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