台北市長柯文哲昨(5)日公布台北市民免費接種疫苗，由於行政院也宣布，編列40億元預算，免費施打公費疫苗，外界因此批評柯文哲「收割」，對此，柯文哲今(6)日下午在防疫記者會，進一步解釋在公布前，不知道中央政策跟計畫，但台北市將朝減少行政流程、補助規費方向進行，提高施打意願跟普及率。
柯文哲指出，無論類別、不分公費、自費， 全部免費，如果以人頭計算，每劑補助醫院100元，以設籍在臺北市16歲以上的人口數來計算，約有223萬人、假設每人2劑為單位計算，接種涵蓋率要達50%，就要2.23億元；如果接種涵蓋率要提升到75%，就要3.345億元。
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柯文哲指出，過去接種疫苗，因為醫療單位不同，會酌收掛號費、問診費或是注射費等等規費，費用大概是50塊錢到數百元不等，例如，以前到地區中心、或是醫學中心注射流感疫苗，要收100到200塊錢，在聯合醫院就是收50塊錢、健康服務中心門診部還是要收費、里長設站不用錢。但是這樣就會出現問題，民眾不去大醫院打疫苗，變成無法普及，因此必須減少行政流程跟民眾負擔，才能提高施打率。
因此，市府將朝三個方向進行，包括第一，減少繁瑣行政流程，每打一劑補助100塊；第二，減少民眾負擔跟醫院成本；第三，最重要的就是增加接種率。柯文哲也進一步解釋，中央說在6月3日就通過免費接種疫苗，但市府沒有收到公文˙，根本不知情，台北市衛生局跟醫院也都沒有收到通知，對於中央的說法樂觀其成。
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