衛福部長陳時中在指揮中心記者會上，強調放寬機組員檢疫期為「3+11」的政策並非防疫破口，引發不少論戰，對此台北市長柯文哲也批評，政府不需要否認錯誤，要想如何拯救正在貧困裡掙扎的老百姓。
指揮官陳時中首度反擊，否認3+11是破口，更做出了解釋。
衛福部長陳時中：「當然有一些機組員家人，諾富特裡面員工，他是在裡面的一個事件，算是一個群聚事件，並不算是一個社會的破口。」
不過此話一出，台北市長柯文哲很不是滋味，說現在追就3+11已不重要，八百多人因此死亡，感染源還在社區中潛伏，這讓他更戒慎恐懼，政府不需要去否認錯誤，應該要想如何堵住破口，不讓他再度發生，而藍營立委也當然不買帳。
立委(國)馬文君：「3+11不是破口，什麼才是破口，陳時中部長睜眼說瞎話，當初他說要負責，其實沒有人要誰負責，因為沒有人可以為人命負責，我們需要的是執政黨，必須要認錯而且要改進。」
會這麼說也是因為先前部長陳時中在立院證實，蘆洲、宜蘭確診個案的基因定序與諾富特染疫機師相同，但現在部長認為這不是破口，這800多條人命又該誰來負責？
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