台灣氚排放標準是每公升五萬貝克，反觀日本這回排放的，檢驗結果低於1500貝克，而且也通過國際原子能總署認可，但各國卻還是有疑慮，因為擔心過濾系統，是否真的把其他有害放射性物質都有過濾掉，而且排放就是30年，過濾系統有沒有更新，也很關鍵。專家建議，政府應該申請到日本排放區，直接進行海水檢驗，同時密切監測魚類，替食安把關。
大陸質疑是「核汙水」。
清大核子工程與科學研究所特聘教授葉宗洸：「那時候發生事故的爐心，水裡面就有放射性同位素，alps系統可以有效過濾廢水，大陸不相信他們透過過濾，其他氚以外核種都過濾掉。」
清大核子工程與科學研究所特聘教授葉宗洸：「半衰期長會有生物累積效應，現階段可能都符合標準，但最終我們應該是長期監測。」
尤其排放計畫長達30年，也引發另一個質疑。
清大核子工程與科學研究所特聘教授葉宗洸：「我們要確認30年期間，過濾效率是不是維持很好，有沒有定期更新，到了後期不遵守原規定，有可能核種數量變多。」
排放計畫已成定局，專家建議政府除了持續監控日本進口，還有遠洋捕撈的漁貨，也應該加緊腳步申請，到日本排放區第一線的海水檢驗，其他有害物質是否如同日本所說，活度低於標準很多。
綠色和平組織專案經理古偉牧：「吃到海鮮，根本不知道從哪個地方，也不知道魚類到底有沒有輻射性物質，氚到底是不是安全的，這個在科學上根本也沒有結論。」
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