現在世界各國都在部署第三劑的加強疫苗施打，我們台灣要打到第三劑，也可能會面臨一些難題，因為我們除了AZ、莫德納、BNT、高端疫苗，現在AZ疫苗也能夠混打，這麼多的施打組合，第三劑該怎麼打也得要謹慎思考，專家也強調，已經打兩劑AZ疫苗的民眾，第三劑應該要混打mRNA的疫苗，要買多少量，政府都應該要提前準備。
工作人員：「請問施打疫苗的嗎。」
預約施打疫苗民眾，陸陸續續報到，除了第一劑就接種BNT疫苗之外，還有原本接種AZ疫苗，預約混打的人也不少。
為了提升保護效果，不少施打AZ疫苗、高端疫苗的民眾，第二劑選擇打mRNA的BNT疫苗或是莫德納疫苗，但光是第二劑的亂象就層出不窮，曾經發生打錯疫苗的離譜事件，第三劑誰要打、打什麼，也有醫師憂心會更加混亂。
北醫胸腔內科主任周百謙：「目前的確是一個(疫苗)戰國時代，只是能夠買得到或不能買得到，所以這種亂象其實對於負責施打的醫院端，或是一些負責的一些衛生單位，則是有打錯的風險，因為疫苗的部分選擇性越多，包含保存低溫運送冷鏈如何去稀釋，如何去確認被施打者的身分是否正確。甚至打完之後的觀察，我覺得衛生機關的問題會比較嚴重。」
中華民國防疫學會理事長王任賢：「台灣如果真的要開始接種三劑的新冠疫苗，不必把這個流程變得那麼複雜，就是腺病毒載體疫苗，不能當作三劑的一個標的，因為腺病毒載體疫苗，它越打效果越差。」
境外突破感染的案例數增加，也讓追加第三劑勢在必行，目前全球已經有41個國家施打追加劑，日本宣布，18歲以上第二劑疫苗施打完超過8個月，就符合第三劑的接種資格，而最快從12月開始，年長者就能打。而我們台灣預計明年初，一到三類的民眾，可能優先施打加強劑。
指揮官陳時中(11/19)：「第三劑基本上我們還是讓大家以同廠牌的為主，那如果要混打基本上各國都朝這樣子的方向，縱使會有(第三劑)的話最快也到一月底了。」
長庚大學新興病毒研究中心主任施信如：「早一點打的不管什麼樣的組合，不管怎麼樣的牌子，在3到6個月以後，這個疫苗就是打過疫苗的抗體，會慢慢降低，那降低以後突破性感染的機率，當然是提高了很多，那現在各國都有這樣的現象，他如果是在今年年初就打了，那當然現在很久了是需要打。」
指揮中心強調，將召開ACIP專家會議，討論第三劑的接種計畫，根據統計2022年1月底，約有26.3萬人打完第2劑後間隔6個月以上，分別是AZ疫苗約16.8萬人，莫德納疫苗約9.5萬人，而台灣從疫苗備貨再到施打速度，全都落後先進國家，專家呼籲，現在加強劑的疫苗購買，恐怕不能再慢半拍。
北醫胸腔內科主任周百謙：「第三劑的追加我覺得政府必須要提早去做準備，其實現在必須要跑大數據了，那看看台灣這段時間，兩劑施打的一個分布的一個情況，譬如你已經兩劑AZ疫苗了，第三劑必須要讓這些國民優先注射mRNA的話，這些的量要多少。」
台大公衛院教授陳秀熙：「第一代疫苗的改良已經也快要出來，那台灣是不是能夠精準的，這樣一個去做提前的思考部署，全世界打第三劑的時候，我希望我們的第三劑有可能打到，最有效精準的次世代疫苗。」
接下來要面對的，還有春節大批返台民眾，防堵的作為不能少，加強劑的布局得加快腳步，不能亂象加亂、讓台灣再成為疫苗後段班。
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