台灣引發疫苗之亂，國際疫苗少量到貨但部分有副作用疑慮、國產疫苗二期都還沒通過，那麼免疫力低下族群到底能不能打疫苗，尤其這段時間還必須出入醫院的孕婦和癌症病友都很擔心。專家表示孕婦接種疫苗不會增加流產風險，而且新生兒可能一出生就有抗體，更建議接種輝瑞BNT或莫德納疫苗，此外癌症病患只要看對時機點也可以打疫苗。
台灣周產期醫學會理事長、台北長庚醫院婦產科系主任洪泰和醫師和數家醫學中心產科醫師專家，針對孕婦是否適合接種進行討論達成共識，指出孕婦感染新冠肺炎後會有比較高的風險惡化成重症、發生早產、以及讓新生兒入住加護病房。而根據國外超過3萬例孕婦接種新冠肺炎疫苗的臨床經驗，在孕期任何階段接種疫苗，並不會增加流產、胎兒畸形、早產、胎死腹中、或其他妊娠併發症的風險，因此是可以接種新冠疫苗的。
學會秘書長、高雄醫學大學附設中和醫院婦產部詹德富醫師表示，雖然新冠肺炎疫苗雖然都是緊急授權使用，但像是美國婦產科醫學會和世界衛生組織都指出，備孕、懷孕、以及哺餵母乳並不是施打疫苗的禁忌，尤其國外已經有超過3萬名以上孕婦接種過新冠肺炎疫苗，甚至有研究報告顯示，孕婦施打新冠肺炎疫苗，新生兒身上也可以測到保護的抗體。
馬偕紀念醫院婦產部黃建霈醫師則說，孕婦感染新冠肺炎後入住加護病房、使用呼吸器或葉克膜維生的風險都比較高，尤其是高齡、肥胖、或同時有糖尿病、高血壓、子癲前症等併發症的孕婦，希望在將來疫苗較為足夠時，政府可以考慮將孕婦也列為優先接種疫苗的族群之一。
洪泰和醫師強調，孕婦要不要接種新冠肺炎疫苗，應該視個人情況，評估過可能的風險和好處後再施打，如果有疑問的話，也可以和醫生討論過後再做決定。
此外癌症病友也是高風險的族群，台北癌症中心院長暨北醫附醫癌症副院長李冠德指出，現在門診遇到不少癌症病人及家屬詢問接種疫苗的相關問題，他表示癌症病人屬於免疫力低的族群，一旦感染病毒脫落的時間較長、產生變種病毒的機率也較一般人大，所以病人以及他們的家庭接觸者應該優先接種。
雖然癌症病患可以打疫苗，但是接種時間點需要注意，像是乳癌、大腸癌、肺癌等實體腫瘤病人，會接受化學治療或標靶治療，如果能選擇在白血球上升時接種疫苗會更好。白血病、骨髓瘤、淋巴癌等血液癌病人，通常會接受較強度化療及白血球增生劑，最好延遲疫苗接種直到中性白血球數目恢復，也接受造血幹細胞移植的話要等待3個月後才能進行疫苗接種。
至於免疫治療、放射治療期間其實也可以打疫苗，但是放療手術後病人容易發燒現象，至少7到14天後才接種疫苗。若接受脾臟切除手術，有可能導致免疫抑制狀態，建議術後至少14-21天後才接種。
不過李冠德說輝瑞BNT、莫德奈疫苗雖然對癌症患者不會造成直接風險，保護力也高。但高達16%病人接種後會有暫時性局部淋巴腫大，因此建議電腦斷層或正子掃描等腫瘤評估，可以安排在接種第二劑疫苗結束後6週，以免誤當成腫瘤轉移。
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