外界積極想協助進口德國BNT疫苗，但食藥署署長吳秀梅卻聲稱德國BNT沒有緊急授權。台北市議員游淑慧踢爆，衛福部早就通過德國BNT疫苗的緊急授權，卻故意在今（30）日凌晨連夜下架相關檔案，對此指揮中心指揮官陳時中回應，如果進來要施打一定會有緊急授權，但沒有進來就不會有。
國民黨籍台北市議員游淑慧表示，疾管署於今年3月10日頒布的疫苗接種需知暨意願書，也就是發給打疫苗民眾的文件，明確看到除了有AZ、莫德納的選項之外，還寫著Pfizer/BioNTech疫苗， 甚至文字還稱已取得我國緊急授權，卻被疾管署連夜下架。
指揮中心指揮官陳時中表示，說如果有疫苗進來要打一定會有緊急授權（EUA），但是沒有進來就不會有，因為和德國BNT談判有遇到問題，但沒有放棄希望，尤其後來COVAX有表達可能分配輝瑞BNT給台灣，確實有提到會給9萬5千劑，所以台灣在開打時就把它列進來，而且5月3日COVAX表示無法提供，當時就覺得疫苗接種書沒有必要特別改，才會把文字留在上面。
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