台海危機受到全球關注，「台灣有事」也成為日本政府的重要議題。一名日本退役將領近日接受訪問時表示，若台海危機爆發，日本應扮演烏俄戰爭中波蘭的角色，收容大量台灣難民。然而，與台灣近在咫尺的日本離島居民，卻認為日本政府沒有做好準備。
《路透社》報導指出，部分與那國島居民擔憂台灣有事引發難民危機。與那國島以西110公里處就是台灣，若台灣有事，與那國島勢必首當其衝。該島嶼孤立的前哨與不滿1700人的人口，恐難以承受這場危機發生。
為了防止潛在衝突，日本防衛省9月宣布2024年度預算概算需求，要求編列7兆7385億日圓（約1.6兆元新台幣），創下歷史新高。但報導指出，日本沒有進行妥善規劃，為與那國島可能發生的人道主義危機做準備。
20多名現任與前任日本官員和與那國島居民表示，若北京武力攻擊台灣，可能會有數百名至數千名台灣難民，試圖抵達與那國島，但日本政府未針對收容難民制定計畫。與那國町町長糸數健一透露，日本官房長官松野博一7月造訪與那國島時，他曾經直接向對方尋求幫助，卻沒有得到回應。
日本首相岸田文雄2022年警告，東亞恐成為下一個烏克蘭。屆時駐紮在與那國島的200名自衛隊員，可能會成為首批處理難民危機的人員。然而在岸田多達百頁的軍事擴張文件中，僅提過一次難民問題。
一位匿名美國官員透露，日本政府對於在與那國島實施具體人道主義計畫感到猶豫不決，此舉可能會讓北京認為日本在為台灣衝突作準備。就算日本擬定好計畫，仍需要面臨另一項阻礙：日本政府與管理與那國島的沖繩政府存在爭議。
據報導，沖繩縣知事玉城丹尼想減少駐紮在該地區的美軍人數、反對岸田軍事擴張。他同時認為，首相必須負責管理搭船抵達的難民。就算交給地方政府負責，相關權力與財政資源現在仍不明確。
沖繩和東京官員3月首次進行兵棋推演。官方推測包含與那國島在內的日本西南諸島上，大約有12萬居民和遊客，疏散行動預計將花費一週。演習顧問中林啓修當時表示，若台灣難民湧入，可能會導致系統不堪負荷。一名日本海上保安廳官員透露，台灣有事發生後，預估會有數百艘船突破封鎖，開往日本。
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