國務機要費案，在檢方約談陳總統後，案情進入核心；當初審計部要查一筆用途不明的2,400萬機要費，總統府以「機密」為由拒絕配合，檢察官陳瑞仁接手後，為此親自前往總統府，終於取得並扣押機密費領據和支出憑證，檢方正在逐一比對。
國務機要費案中，一直無法突破，也無法掌握的關鍵拼圖，就是一筆3,600萬用途不明的費用。
當初審計部查核92年到95年支出，需要單據核銷的7,200萬中，有憑證的只有一半，其中包括李慧芬提供的發票金額1,000萬，另外3600萬怎麼花的，完全沒記錄。
總統府甚至以機密為由，不讓審計部查核，但檢方接手後，已經取得領據，扣押證據。這要歸功承辦檢察官陳瑞仁，為了取得敏感的機密費領據，他至少親自前往總統府2次，雖然府方一度拒絕配合，陳瑞仁最終還是技巧性地取得資料。
而外界更關注的是，這筆錢是真的花在「機密」用途，還是第一家庭成員的私人用途？二度回台的李慧芬證實，高檢署曾拿出總統府提供的機密費領據，讓她指認。
台灣紅負責人李慧芬：「最多的部分是國賓飯店的，裡面還有官邸的一個陳先生，我不知道他的全名，陳明哲嗎？」
國務機要費迷團，隨著檢方約談核心任務，掌握關鍵證物，真相正在拼湊還原。
