國務機要費貪污案，陳水扁總統替夫人叫屈，說吳淑珍願意再說明，是檢方拒絕，大喊不公平！對此，陳瑞仁手機關機沒有回應，但他在起訴書上已明確指出，陳水扁夫婦無法提出送禮的具體姓名和證據，涉嫌貪污，加上證明甲君是編造出來的秘密人物，檢方認為沒有必要再偵查。
第一夫人吳淑珍遭到起訴，總統陳水扁大喊不公平，直說吳淑珍願意多做說明，是檢方不願意！不過起訴書一出爐，陳瑞仁也關機休息，不與外界聯繫。陳瑞仁：「我是陳瑞仁，請留話，謝謝！」
但拿出起訴書，厚厚一大疊，詳載起訴原因！包括在8月22日，陳瑞仁訊問吳淑珍，發票交由何人？如何領到錢？吳淑珍回答，在怡佳行買了10多萬的圍巾，毛衣6、7萬，仁綢布莊買的服飾加圍巾高達30多萬，是送給層級較高的女性外賓或男性外賓的妻子。
在宏佳銀樓買的金項鍊，黃金擺飾是贈送本國人，包含年長者、新婚或新生兒，但陳瑞仁2次訊問，陳水扁無法說出具體姓名，相關發票也沒有檢附任何領據或註記，因此被認定有貪污嫌疑！
所有的發票，陳瑞仁明列附表，從陳致中在金石堂花的2、3百元，甚至是買藥錢，包括時間、地點，還有提供人，巨細靡遺，也讓人不禁懷疑，藥品也能當禮物嗎？
此外還有甲君，也就是龔金源，光是這一部份，陳瑞仁查出52張發票，外加上14項論證，證明甲君是編造出來的秘密人物，戳破謊言。
辦案辦到幾乎白髮的陳瑞仁，細心求證，自認經得起考驗，起訴書等於說明一切，第一夫人也沒有再多說的必要。
