民眾黨主席柯文哲近期風波不斷，不只假帳爭議、逛豪宅話題延燒，又爆出以選舉補助款購置個人商辦，疑似納為私用，引起民眾黨員及支持者不滿，曾代表民眾黨參選立委的淡大助理教授何景榮就點出，柯文哲應辭黨主席一職，並推舉黨團總召黃國昌任代理主席。對此，陳智菡表示，各界的想法都有聽到，目前希望以團結為優先，先把事情解決並釐清真相。
柯文哲日前被爆出砸4300萬「秘密買房」，柯文哲隨即證實用選舉補助款買房作為「個人辦公室」，不過，又遭外界質疑「將選舉補助款變生活補助款」。陳智菡對此強調，民眾黨目前是以立法院為中心的政黨，因此新商辦購置於立法院附近，不論要用於柯的個人辦公室或是智庫發展，「柯文哲都不是納為私用，而是以黨的發展為主」。
然而風波不斷，各界支持者紛紛提出看法，網紅「館長」陳之漢就力挺「阿北沒錯」，並透露柯文哲找他大吐苦水，還抱怨沒有電視台願意做專訪讓他澄清等。陳智菡說，館長非常好意，從爭議爆發後，館長都認真聆聽民眾黨的說明與解釋，並提出想法意見，而柯文哲應是心有所感才提到政論節目無法平衡報導一事，然而，政論節目現每天全時段攻擊，單一次專訪能否改變現狀，還要再評估。
曾代表民眾黨參選立委的何景榮則提到，支持柯文哲請辭黨主席，並由黃國昌代理其職。陳智菡表示，民眾黨正面臨艱困挑戰，各種聲音都有，知道很多黨員希望第三勢力能持續，但因內部問題而未做到監督政府，就會讓支持者失望，她強調黨中央會聆聽黨員、支持者的想法，不過，現階段希望以團結為優先，解決眼前事情。
針對政治獻金疑雲，民眾黨明（29）日會開最終記者會說明，陳智菡強調，會計師端木正漏報的單據已全部找到，且都用於選舉支出，明將完整交代外界所有疑問。
不過，面對一切爭議，柯文哲今早出門時全部微笑避答，快步搭上座車離開。
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