民眾黨總統候選人柯文哲在第二場總統政見發表會中，談到核能議題，嗆民進黨總統候選人賴清德若真的堅持2050非核家園，企業界的票先跑掉一大半，更稱賴若迴避就代表沒長期規劃、只想炒短線，而賴回是因為核電廠時間到將其停掉。柯文哲發表會再指，賴清德回答是誤導，「核電廠是可以延役，今天是民進黨不延役才停掉，所以賴清德禁不起科學上考驗，明顯誤導全國民眾」。
賴清德在最後一輪表示，2050非核家園並不是總統蔡英文把可以運轉的核電終止，而是因為法律規定，最後一個機組，核三廠2號機必須在2025年期中停止運轉，還好蔡總統因應局勢推動綠能產業發展，否則今天會更慘。
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柯文哲在會後接受聯訪時，強調自己沒攻擊對手，但他認為賴清德的回答是誤導全國民眾，說是因為核電廠時間到停掉，問題是核電廠可以延役，是民進黨不延役才給它停掉，「所以賴清德那個禁不起科學上考驗」。
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柯文哲認為不管誰執政，都要嚴肅面對能源題目，不贊成用意識形態解決科學問題，台灣半導體產業太耗電，要轉型也不是一天兩天可以做到，加上最近2050淨零碳排放是很大壓力，因為很快要克碳費、關稅，核電會便宜很多，所以這也是國人要思考，如果核電比較便宜、用石化燃料比較貴到底要怎麼辦。
柯指出，經過三哩島、車諾比等事故後，核電安全性是有提高，自己去日本考察過，別人的失敗就會改進，所以核電安全係數有提高，「但問我是不是絕對沒有危險，當然不能這樣講，到馬路上也有可能被車撞到，但有可能不上街嗎？還是要理性務實討論」。
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