新冠肺炎爆發以來，疫苗採購決策、會議紀錄、採購金額備受爭議，衛福部將這些資料列為「絕對機密」封存30年，引發外界質疑黑箱掩蓋貪汙圖利。對此，台北市長柯文哲今（26）日表示，疫苗一定是買貴，所以才不敢公布，要封存30年一定有問題，「一定買比人家貴很多，不敢講，才要藏起來嘛！」
國民黨近來猛攻疫苗合約採購爭議，要求前衛福部長、民進黨台北市長參選人陳時中公開疫苗價格，但陳時中表示，包含聯合國資料庫在內，疫苗價格都是用推算的，沒有國家直接公布單價。據指揮中心公布國內單支買疫苗均價為台幣765元，但據聯合國兒童基金會（UNICEF）官網公開不同品牌單劑疫苗價格顯示，每劑價格約10美元（約台幣302元），兩者價差頗大。指揮中心發言人莊人祥則解釋，網站上所公布的價格非各國直接提供而是蒐集網路資料，多數來自於媒體的報導，無法證明各國違反保密協定。
對此，柯文哲今日出席「2022台北城市博覽會開幕記者會」，針對我國疫苗採購價格似乎比世界平均還貴一事，柯文哲指出，「如果比世界便宜早就公布，要封存30年一定有問題，用膝蓋想也知道」。他直言，以政府角度買比別人便宜一定會拿出來講，「一定買比人家貴很多，不敢講，才要藏起來嘛！」
另外，針對台南殺警案引發外界質疑外役監遴選標準，柯文哲直言，事情發生國民黨怪民進黨、民進黨怪國民黨，以科學角度來評論，這是典型的「瑞士乳酪理論」，是很多環節出錯才出現這局面，他比較擔心罵來罵去都沒有解決。
至於前新竹市長林智堅喧騰近兩個月的「論文門」風暴，在半個月內遭到「雙殺」結局，柯文哲表示，非常清楚不只有林智堅，且他作為台大醫學院的教授，認為老師要負比較大責任，因為是老師讓他畢業的，這已經是個共犯結構，對林智堅來講，「他算是悲劇吧」，兩個碩士學位被拿掉，包含中華大學、台灣大學，「其實我知道很多大學都有啦，這個倒也許也是個機會，讓大家心生警惕，以後不要再有（抄襲）了」。
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