陳時中將代表民進黨出征台北市長選戰，原先衛福部長及中央流行疫情指揮官的的職位，也在今（15）日由行政院公告，分別由薛瑞元及王必勝接任，其中針對王必勝接任防疫指揮官，柯文哲先是感到訝異，並直言透露指揮官的更好人選是賴清德。
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台北市長柯文哲今日赴台北市議會備詢時，市議員陳建銘在質詢時提到了王必勝接任防疫指揮官，柯文哲聽見消息後露出了相當驚訝的表情，並再次確認「防疫指揮官是王必勝？」，陳建銘隨後詢問柯文哲的看法，柯文哲則表示：「我回去再研究一下，沒事就沒事，有事就會出問題」。
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柯文哲認為，防疫指揮官還是要有團隊，且不只是針對防疫，還有紓困、振興、轉型等問題，像是邊境是否開啟，不會只是衛福部來決定，還會涉及國防部、經濟部與外交部、防疫指揮官來決定。此後，陳建銘繼續追問柯文哲，誰才是最好的防疫指揮官人選，柯文哲對此表示：「賴清德是比較好的選擇」。
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