萬事莫如防疫急，但有立委踢爆，衛福部1466億的防疫預算中，編列買藥的預算僅僅20億，隨著確診人數暴增，目前預算已經入不敷出，恐怕得向中央討救兵。但先前指揮中心強調，不足的部分會用公務預算、「以緩濟急」的方式處理，急需的藥物一定會買到，民眾不用太擔心。立委則表示，雖然可以從別的地方籌措財源，但希望政府可以盤點資源，接下來剩餘的1200億，一定要把錢用在刀口上。
公費清冠一號看得到、買不到，民眾只好尋求黑市，買高價的類清冠自救。為此衛福部國家中醫藥研究所和中醫師公會聯手，最新推出公費清冠一號動態查詢表，結合近1400家中醫診所，每天晚上1200前，盤點清冠庫存、即時更新，8大中藥廠也產能全開，希望補足缺口。
國家中醫藥研究所所長蘇奕彰：「在這一段時間大家加緊努力之下，看起來數字是可以往上提高到20.30萬(份)左右，所以這個數字正在升高。」
國家中醫藥研究所所長蘇奕彰：「民眾因為急著要拿藥，所以在公費之前就先自費呢，在他快篩確診之後，因為大家知道到PCR，大概也要有12天的時間，所以這中間的落差，大概是我們民眾對清冠一號很有信心，也希望儘快拿到，所產生的一個(缺貨)效應。」
藥物的安全存量攸關抗疫成效，近期指揮中心緊急加碼採購新冠口服藥，但就怕口袋已經入不敷出，根據國民黨立委傅崐萁提供的數據顯示，8400億整體防疫預算中，交給衛福部使用的為1466億，其中編列拿來買藥的20.8億，目前花掉14.5億，剩餘只剩6億多。不過帳目沒列出來的已決標未支付數，也就是下了單、尚未付款的買藥金額缺口高達201億，一旦疫情延燒，舉債還得追加嗎？
國民黨立委曾銘宗：「還有1千億還沒有用的，特別預算裡面可以挪用這第一點，第二點可以挪111年度的預算，第三點也可以挪基金跟非營業基金的預算，第四點還有第二預備金，行政院的第二預備金也可以用，所以基本上有四個來源，基本上錢沒有問題，真正有問題(的時候)，真的疫情很嚴重要防疫紓困振興的話，到時候再來討論。」
政府的超前部署漏洞百出，也難怪台灣民意基金會最新民調顯示，相信政府有做好準備的民眾只占整體的3成7，不相信政府的民眾高達5成之多，先前踢爆政府臨時抱佛腳、拖到4月才砸184億買快篩的立委高虹安呼籲，各部會必須盤點資源，把錢用在刀口上。
民眾黨立委高虹安：「我們其實還是很懷疑啦，就4月6號的時候，總統府官邸的會議裡，所出示的這個指揮中心的4月1號的這個報告裡，不是就特別提到說，疫情在台灣將大規模的擴散，也提到了說篩檢跟藥物跟相關的量能，必須要預先去做準備，可是看起來我們的疫情到了現在就是，預算錢都給你了，可是你卻沒有及時雨地，把它花在正確的這個事情上面。」
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