馬英九的特別費案無罪定讞，現在換成教育部長杜正勝得為這件事情傷腦筋。民進黨團乾脆提案，要修正會計法，讓97年6月1日之前的相關費用處理通通除罪化，其中也包含總統的國務機要費。不過國民黨團對於除罪化的範圍態度保留！陳水扁總統能不能適用這套法令？藍綠還有歧見。
總統夫人吳淑珍就出了這麼一次庭，國務機要費的案子再也沒有下文。現在民進黨團積極修法，試圖為特別費以及國務機要費案，一併解套。民進黨團幹事長賴清德：「與其讓馬英九上任之後，來特赦特定的人，不如我們全面性的、根本的，來解決這個問題。」
民進黨團提案修訂會計法，上至總統府的國務機要費、下到村里長的事務補助費，將通通訂定明確的使用規範，草案中還加註，新法將從今年6月1日開始實施。至於6月1日之前的特別費等使用狀況，相關人員責任通通解除，也就等於為國務機要費以及特別費完全解套。
賴清德：「國務機要費的性質，本來就是特別費的性質啊。」國民黨政策會執行長林益世：「歷史的包袱總是要處理的，但是社會的觀感大家也是要注意，國務機要費的部份，我們現在是反對的。」
為特別費除罪化，藍綠有共識，但解套的範圍要到哪裡？顯然還有得喬！只是無論如何，就算法案通過，已經被判刑確定的余文，依舊只能就還沒執行完畢的部分，免除刑責，除非總統特赦，否則逃不了牢獄之災這一關。
