長榮航空3名機師日前確診，由於機師先前實施加強版自主健康管理，無密集接觸情況下可自由走動，可傳染期間足跡遍佈桃園、雙北、高雄。指揮中心4日針對足跡重疊民眾發送110萬封警示簡訊，卻有民眾困惑沒去過公布足跡地點卻也收到簡訊，引起不少爭議。台北市長柯文哲夫人陳佩琪對此指出，民眾收到簡訊當然會恐慌，反射動作就去快篩，批評指揮中心「把簡訊發了就沒事了」。
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陳佩琪6日傍晚在臉書發文指出，指揮中心一下子就發布百萬則簡訊「搞得人心惶惶」，她認為民眾當然會恐慌，反射動作就是跑去快篩，她批評「有些人做事的心態就是這樣，反正就是把簡訊發了，有通知到你就好了，後續沒他事，也沒他責任，往後急診被塞爆，累死醫護和嚇壞百姓，也不關他的事」。
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陳佩琪也談到機師是否該打第三劑疫苗的問題，她認為疫苗不夠又讓人打第三劑，會引起打不到第一劑民眾的不滿，指出，第三劑應該是打完第二劑後的6至8個月才有需要，並非當下迫切需要考慮的。「要避免現在面臨的break through infection（突破性感染），回過頭來想想當初該怎麼做最好？」。
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對此，指揮中心發言人莊人祥於4日解釋，該次的細胞簡訊主要是以3名確診機師、1名確診高中生的電子軌跡為基準，若是個案在特定地點停留比較久，周遭的民眾都可能收到簡訊。由於機師返台後，實施「加強版自主健康管理」期間還是可以外出，只要不聚餐、聚會，行動還算自由，也不是所有足跡都有對外公布，因此簡訊發布範圍雖以桃園市為大宗，但雙北、新竹、高雄等各縣市的民眾都有可能收到簡訊。
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莊人祥也指出，匡列的日期之所以回溯至8月13日，是以最早確診的機師（案16066）採檢日8月27日為基準，由於個案無症狀，只能以採檢日再往回推14天，加上該機師確定感染最早在印度發現的Delta變異株，因此把發布簡訊的範圍擴得更大，謹慎以對。 莊人祥提醒，民眾即便收到簡訊也不用過於緊張，發布簡訊目的是提醒民眾監測自己的健康狀況，一旦發現異狀必須儘早就醫，但如果都沒異狀，就更不需要擔心。
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