太魯閣號事件後，台鐵公司化的問題再度引發討論，而台鐵內部傳出，去年9月就提出組改計畫，並規劃了四大方向，包含從營運和資產債務等，研議公司化改革，同時打算設立分公司，負責不動產開放和商場業務，但台鐵工會也擔憂，一旦轉為公司化，權益會受到影響，不過台鐵規劃，員工還是可以保留公務員資格，或清算年資進入公司體制。
台鐵內部資料傳出早有公司化的計畫，四大面向進行，若改組為台鐵股份有限公司，由政府百分百持股，鐵路建設，營運維修，公司化後變成鐵道局出錢建設，台鐵改用租用，若沒有賺錢能比照北捷1元向政府承租。
另外旗下還要組成台鐵資產開發分公司，負責不動產開發、都更，至於周邊商品規劃設立鐵路副業營運分公司，車勤，文創，觀光附屬產業，增加收入來源，多元發展。
財經專家李永年：「台鐵不是不行，而是有很多制度的僵化，所以我覺得如果公司化以後，對他的周邊商品，周邊的企業經營，應該能更放手去做。」
活化地產蓋商場，調整票價，轉虧為盈，高鐵和日本國鐵都是很好借鏡，除此之外，公司化下，人力也是一大重點，台鐵每年約12億支出加員工退撫金等，歷史性財務包袱，每年約40幾億元，目前已經負債4千多憶，規劃由政府作價給債務基金，暫時承接台鐵重擔，公司化做成，績效有獲利，再逐步償還，至於員工可選擇保留公務員資格，或清算年資進入公司體制。
台鐵產業工會理事長王傑(4/7)：「大家是辛苦國家考試進來的，結果你一句公司化之後，結清所有大家的年資，那身分待遇，是不是就沒有任何的保障。」
工會擔憂改成公司模式經營，原本該有的權益受到影響，更有財團化風險，反而拖延台鐵對人力和安全的改革，去年9月就有提出組改計畫，原定4月中要和交通部長簡報，沒想到卻發生太魯閣號事件，讓公司化構想再度浮上檯面。
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