頂尖大學計畫執行10年，花掉政府上千億，卻和原本預期成效有落差，現在教育部決定停辦頂尖大學計畫，改為由各大學自選標竿學校，希望3到5年內追上或是超越標竿學校，但是經費一年由原本的100億減為60億；相較之下中國大陸的高教經費卻是逐年增加，尤其北京清華大學，一年經費大約等於台大的6倍，讓這些頂尖大學感嘆，想要跟國際一流大學競爭越來越辛苦。
頂尖大學這個名詞，來自於政府從2006年開始推動的「邁向頂尖大學計畫」，以5年為一期、一期500億預算，目標是「10年內產生一所排名世界百大的國際一流大學」，並且在「5年內發展出10個亞洲一流的頂尖研究中心」，10年多來總共花了上千億，得到的結果卻是令人失望。
台大研發長李芳仁：「假如說隨便講個排名，假如我們100的話，10年前中國大陸他們大概在140左右差不多，可是他們已經遙遙領先，他們搞不好已經他們大概到60，我們還在100，所以我們沒有往前進，搞不好就被往後推了啦！」
根據英國泰晤士報高等教育特刊，最新的排名國內最好的台大只有198名，連續5年退步，已經被中國大陸的上海交通大學、浙江大學及南京大學追過，另外清大和成大排名也是退步，現在教育部決定停辦頂尖大學計畫，改為由各大學自選標竿學校，希望3到5年內追上或是超越標竿學校。
高教司長李彥儀：「這次高教深耕最重要的地方，是希望學校能夠找到自己的定位跟發展，因此我們鼓勵學校去找國際的一些知名的大學，找到一個或數個知名大學，作為他標竿學校。」
這項計畫命名為高教深耕計畫，5年編列590億預算，第一年總經費為173.7億，其中113億延續教學卓越理念，所有大學都可望分到，第二部分類似以前的頂尖大學計畫，但經費由以往100億減為60億。
高教司長李彥儀：「第一部分是針對教學創新，這一部分整個的經費是有88億，第二部分在研究的部分加起來有60億，所以加起來整個是100多億，是比以前還多很多。」
台大研發長李芳仁：「這個資源在這裡、學生在這裡、老師在這裡，你看這三塊是會互相影響，你今天學生在這裡，你資源夠，學生覺得我在這裡，受教育的東西比較好的話，我願意留下來這邊，受教育資源夠，老師因為資源夠學生也很好，他願意回來你經費不夠，學生受教育的一些東西，沒有跟國外比較好的大學來比，學生很聰明現在一上網就知道。」
反觀中國大陸高教育預算逐年增高，2017年北京清華有233億人民幣，約合台幣一千多億，相當於台大的6倍之多，北京大學一年也有193億人民幣，排名第三的浙江大學，則有一年150億人民幣，其他像是上海交通大學、中山大學、天津大學、復旦大學，每年都超過100億人民幣預算，也難怪台灣的大學在國際排名競爭越來越辛苦。
台大研發長李芳仁：「我們現在事實上，也時常跟我們大學部的學生來做溝通，希望說不要因為國家一時的經濟沒有起飛，而不願意再去做更嚴峻的挑戰。」
學者話說得直接，國際排名的比拚比的就是經費，很殘酷！既然如此未來台灣高教，應該怎樣才能走出一條活路？
德明科大主秘饒邦安：「教學其實是最基本的，所以這次高教深耕計畫未來5年，全國157所大學資源重新整合分配，那有滿大的比例在老師的教學、學生的學習，我覺得這是很適當。」
科技大學透過辦營隊的方式，和高職學生提早互動，等於提早一步搶學生，部分學校選擇專注培養人才，用另外一種形式提升高教價值。
德明科大主秘饒邦安：「要去打國際盃要有國際競爭力，其實就必須要有少數的，少數的學校那資源才能夠集中，以我們學校來說，我們就定位為教學型的大學。」
教育工作者強調，高教資源的分配無法盡如人意，現階段在有限資源，還是得回歸到教學的本質。
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