海棠颱風帶來的豐沛雨量，也使得台灣地區幾條主要的河川水量激增，同時也造成不小的災情。苗栗後龍溪溪水暴漲，沖擊龜山大橋，造成橋墩不穩已經緊急封橋；另外位在濁水溪上游的南投仁愛鄉春陽部落，也因為受到大水掏空路基，對外交通受阻；嘉義八掌溪水位高漲超過了警戒線；還有南部地區的高屏溪，也因為水位超過警戒線，使得高屏大橋暫時封閉。
