針對教改問題，最近國民黨主席連戰及部分教育界人士，都抨擊中研院院長李遠哲應該負責，李遠哲(27日)晚間表示，教改有沒有失敗，還沒蓋棺論定，而且他認為是有一群人，不滿他在兩千年總統大選時的立場，才會藉機抹黑，李遠哲爆料說，當時在投票前，財政部猛查國政顧問團成員的稅，到最後只有一兩位勇敢的人，才敢來開會。
面對凱達格蘭學校青年營的學生，李遠哲談到教改問題，他對於有些人批評他不懂教育無法接受，李遠哲：「上一次總統選舉的時候，我曾經提到我們是要向上提升，或者是向下沉淪，三年期間，我受到很大的壓力，因為總統他有行政資源，很多人也不敢直接得罪他，但是很多人就說，教改是失敗的，然後李遠哲要負責，要抹黑我，但是我並不太擔心，我也是相信很多事情是要蓋棺定論，有人說我只懂得化學，不懂高等教育不懂什麼的，那是不對的。」
李遠哲要反駁的，包括了他擔任教改會成員時，擔任行政院長的連戰，尤其是連戰最近還暗批他是頂著諾貝爾獎的光環，李遠哲：「我從來沒看到，世界上大概沒有說，有一個諮議委員會(教改會)，寫了一本諮報告書交給行政院長，而行政院長連戰要請我們做的，交給他之後，居然在這麼多年之後，說要我負責。」
話題隱約觸及了總統大選時的新仇舊恨，李遠哲更爆料，當年的國政顧問團，被舊政府刻意找碴，李遠哲：「到選舉最後一兩天，政府財政部查稅，做些...，很多很多(企業)受到威脅，到最後選舉前一天，來開會的人就很少，大家(國政顧問團)不敢來，打電話說不敢，不敢來開會，只有兩三個勇敢的人，還堅持到最後。」
結束演講前，李遠哲意有所指說，要批評每個人都會，但是應該捫心自問，要讓社會更好，是不是大家都有責任。
