苗栗、雲林計畫把大選與公投採不同地點分開辦理的方式進行，行政院長游錫堃出面呼籲地方政府要依法行政，而人事行政局李逸洋也表明如有違法將追究法律責任，最重可予以免職處分。
聽到苗栗和雲林打算把大選跟公投設在不同地點投開票，行政院長游錫堃呼籲地方政府要依法行政。行政院長游錫堃：「站在行政院立場，我們呼籲全國選務單位一定要接受中選會的指揮調度否則要負法律責任。」行政院發言人林佳龍：「這個不但違法公投法相關規定，也會涉及到公懲會的懲處，我們希望個別地方官員，不要因為政治的考量、黨派的利益，而陷公務員於不義，也造成人民沒有必要的困擾。」
人事行政院局更強調，320當天如果真有地方政府未遵守中央指令，不排除祭出免職處分。人事行政局長李逸洋：「依照公務員的考績法的時候，這樣子的違抗這個政府這個重大政令啊，事實上最重可以到達免職的程度。」
主管單位行政院以違法懲處，要求地方政府遵守中選會的作業規定，中選會方面則低調表示目前還沒有收到地方傳來的正式公文。中選會主委黃石城：「我們接到公文以後，我們會要求他們按照中選會的規劃來辦理。」
選戰進入倒數，泛藍執政的縣市對公投的辦理方式仍有雜音，行政院以法辦到底的態度，重申力辦320公投的決心。
