面對大陸疫情升溫，日本嚴正以待，要求大陸入境者篩檢PCR，原本指揮中心態度維持現行入境政策，但突然急轉彎，宣布1月1日開始，從大陸入境的4個直航航班民眾，要全面篩檢唾液PCR，但不包含港澳來台者、機組員，只要是陽性，會被通知隔離5+N，同時檢體會送到實驗室做基因定序，隨時監測變異株。
疫情指揮中心指揮官王必勝：「中國的感染人口很多，所以產生變異株機會，會大大增加，我們要偵測變異株，我們要做基因定序，所以需要PCR。」
行政院長蘇貞昌也在臉書發文公告，最新的大陸入境者措施，針對從北京、上海、廈門、成都，這四個直航航線民眾，不包含港澳來台者跟機組人員，預估春節返台3萬人，入境就得在管制區內做唾液PCR，結果不會在機場出爐，而是返家後若是陽性，會通知實施5+N隔離，同時檢體會送到昆陽實驗室定序，從1月1日到1月31日實施，而明年開始外國籍旅客，確診的醫療費用得自費，但只要是本國籍，若要領包含清冠一號，或抗病毒藥物，都還是公費支付，但若是持有居留證者，得要有健保身分，才無需自費。
大陸返台民眾：「上次回來也只有多花10分鐘，而且可以保障台灣人，還有家人的安全，這也是可以保障。」
另外金馬地區民眾，春節交通專案的來台旅客，同樣比照辦理，指揮中心從原先的淡定到緊急加嚴，或許也跟國內疫情有關，原先預估2月底第三波疫情，高峰會在3萬例，但光是12月28日，都還沒明年就已經2萬7千900多例，馬上年末大型活動，再加上過年，台大感染科權威黃立民預估，1月底可能就先高峰飆升到5萬例。
疫情指揮中心指揮官王必勝：「施打次世代疫苗的比例，大概是占我們人口的12%，所以這個覆蓋率，其實目前還是相當低，所以年底尾牙、餐會很多，在不是用餐的時候，也希望大家把口罩戴上。」
面臨大陸明年1月8日大解封，春節返鄉勢必是防疫一大挑戰，政策滾動式調整監測基因定序，就怕新變異株出現，攪局台灣疫情。
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