國內疫苗到貨速度不均，再加上有國際上混打新冠疫苗的研究顯示，AZ疫苗採用混打有機會提高抗體濃度或保護力，國內也進行AZ和莫德納、高端、BNT以及其他組合方式的混打試驗，目前臺大醫院的AZ、莫德納混打組進度最快，院方已經著手整理數據。
指揮中心專家小組召集人張上淳指出，台大醫院的混打試驗中，AZ、莫德納組合收案200人都已經完成第二劑施打後28天的抽血追蹤，初步結果顯示抗體比兩季都打AZ者還要好，也和外國常見的AZ、BNT組合數據差不多。
此外台大醫院內還有「莫德納、高端」，「高端、BNT」及「AZ、BNT」等組合的臨床試驗還在程序當中。
林口長庚醫院分子感染症醫學研究中心主任陳志榮則是主持「AZ、高端」混打研究，他說預計收案百人、月底前可以完成施打，將在滿28天後抽血檢驗中和抗體，半年後還會再抽，也就是說要追蹤到明年5月。
指揮中心專家諮詢委員李秉穎說，AZ混打mRNA疫苗效果高一點在國外就有這樣的數據，台灣是重複研究對於結果不意外，但是保護力高出多少？由於是以免疫橋接的方式觀察，無法直接評論。
但是台灣目前僅有第一類人員可以AZ混打BNT，是否會開放更大規模的混打？李秉穎則說，還是要看疫苗供應的狀況，有多餘的疫苗才有機會，而現在BNT到貨量大可以考慮，還是要指揮中心評量。不過他指出，明年預約很多莫德納的第三劑疫苗，無論先前打過甚麼廠牌，都會遇到混打mRNA疫苗的問題，現在做研究劑受要釐清第一、二劑混打的狀況，才能確保第三劑時不會有問題。
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