疫苗品牌選擇仍是許多人關注的議題，對此有醫師表示，若問第一劑要打哪款疫苗，他建議選擇AZ疫苗，因為目前研究AZ的第一劑保護力最好，且效果幾乎是永久存留，至於何時打第二劑或是混打其他廠牌疫苗，都可以加強保護力，對此指揮中心指揮官陳時中也證實。
陳昶宇再說，若問第一劑要打哪款疫苗，他幾乎一律推薦AZ，目前研究AZ的第一劑保護力最好，且效果幾乎永久存留，什麼時候打第二劑或是混打任何其他廠牌種類疫苗，都可以加強保護力，甚至第二劑間隔時間拉愈長效果愈好，舉例拉長到45週效果會比間隔12週還更好，會產生18倍的抗體免疫反應，及4倍的抗體效價濃度。
至於BNT及莫德納第一劑，保護力可能沒那麼好，但基本的保護力還是有，且打了第二劑保護力會大幅提高，那間隔太久第二劑是否會沒效果？「完全不會」，陳昶宇說明目前相關研究顯示，拉長兩劑間隔到9至15週，可將保護效力拉到最高，有效降低輕症傳染、重症住院及死亡風險。
最後陳昶宇也補充，重點在探討第二劑間隔時間較長的施打後效果，但第一劑打完在一定的週數之後，中和抗體濃度還是會開始下降；對此指揮中心指揮官陳時中也證實，以目前國內疫苗情形來說，民眾先選擇AZ「第二劑的靈活度相對是比較高」，不過還是尊重民眾自己的判斷，自由選擇想打的疫苗。
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