本土疫情陸續爆發，外界認為可能是因為機師檢疫期限放寬成「3+11」導致出現疫情破口，衛福部長陳時中在28號上午，在立法院被問起此事，陳時中當時回答會議是由副指揮官陳宗彥主持，但今(29)日疫情指揮中心記者會中，幫陳宗彥澄清，當天並沒有主持會議，整個改變是由他跟專家討論後決定放寬，陳時中也還原3+11的始末。
陳時中指出，關於華航的管理，在立法院時說是陳宗彥誰主持會議，事實上查了以後，陳宗諺副指揮官並沒有參加這一場會議，當時的會議是由疫情監測組、邊境檢疫組、社區防疫組跟醫療應變組、以及專家們的一個討論，之所以回答是陳宗彥，是因為邊境相關通常都是陳宗彥督導，但是那天他沒有參加，討論完了之後，就跟我面報「3+11」的事情，另外還有帛琉泡泡的相關處理狀況，第二天就以新聞稿方式來發布，4月15日起調整國際航空抵台航班的機組員，檢疫防疫的措施，由我在記者會跟大家宣布。
陳時中說：「這整體的考量，大家也知道，我們去年基本上對於機組員就是3天居家檢疫加上11天的自主健康管理。因為秋冬專案加上有一些個案，就變成7天居家檢疫加7天自主健康管理，在這樣一段時間觀察，境外管理可以落實零接觸，也可以加重航空公司的責任，從1月1日到3月12日，秋冬專案告一段落做一個檢討，在外站的管理跟零接觸有大幅降低，才又改5天採陰後做自主健康管理。」
經過一段時間折衝，疫情指揮中心4月13號檢視相關管理成效，認為法規上已經完備，管理成效違規案件只有一件，而且還是一件誤解的案件，其他都沒有違規，況且在3月12號前採驗了六千多人次，陸續總共採驗了九千多人次，最後才決定回到「3加11」，但專家還是覺得要緊一點點，所以3天採陰後才加11，因此在4月15號公布，陳時中強調這個政策是經過專業討論，也是由我來負責，沒有立委介入或是打電話給我。
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