不過，JYP如此阻礙周子瑜在台發展，有人推測不無可能應與2015年TWICE剛出道時被指台獨有關，當時周子瑜在韓國節目中表示自己來自台灣，並且躺著揮起中華民國國旗，沒想到引來藝人黃安在微博上批評，稱此行為是台獨分子，還要求她公開聲明自己是中國人。
後續引起中國大陸網友大肆批判，使得韓方在中國大陸的演出也受到影響，在龐大壓力下，周子瑜不得不為此發出道歉聲明及影片。 TWICE成軍以來，JYP一直都專注在團體活動，直到2022年，成員娜璉才以首張個人迷你專輯出道，同年7月完成全員續約後，3位日籍成員MINA、SANA、MOMO於去年1月成立小分隊MISAMO，接著在日本發行迷你專輯出道。
接著成員志效也發出個人首張迷你專輯出道。團員中僅剩下定延、多賢、彩瑛與周子瑜並未有單飛或小分隊出道的機會。有TWICE的資深粉絲向本刊表示，外國人本來要有單飛活動就比較困難，之前JYP管得非常嚴格，不能有自己的IG、不能接個人活動，什麼都要團體，是直到續約後才開始能經營和個人活動、小分隊等。不過周子瑜卻一直沒有，粉絲們也都覺得子瑜媽的貼文就是在說JYP。
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