蔡政府致力於落實「2025非核家園」，讓再生能源發電佔比達到20%，其中主要來源為太陽能和風力發電；但近期愈來愈多研究顯示，這些替代能源發電廠「會導致一些物種滅絕」，包括稀有的大型鳥類、蝙蝠以及鳥龜等。
美國奧杜邦學會表示，加州阿爾塔蒙特山口(Altamont Pass)的渦輪式風力發動機，每年約殺死4700隻鳥，「有些鳥的翅膀被斬斷，有些鳥被斬首，有些被砍成兩半。」
而美國加州僅一家Ivanpah太陽能電廠，就已殺死近千隻加州瀕臨絕種的阿氏沙龜(desert tortoises)，同時這家太陽能廠的強光，每年還會燒死6千隻鳥；科學家呼籲，若北美地區的風力發電廠繼續擴張 ，連某些具遷徙習性的蝙蝠，例如灰毛尾蝠(hoary bat)，都有可能會絕種。
但有人提出質疑，認為光美國的家貓，每年就殺死10到40億隻鳥；美國風力發電渦輪每年才殺死14萬到32萬8000隻鳥，兩者數量懸殊影響並不大，對此，鳥類專家解釋，因家貓而死的鳥，大多是常見的小型鳥，例如鴿子、麻雀及知更鳥。
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