日本吐噶喇列島近海，自6月21日起小規模地震頻繁，截至目前已超過千次。3日下午惡石島更發生規模5.5地震，最大震度達6弱，所幸氣象廳已排除海嘯發生的可能性。儘管如此，此強度已達「站立困難，牆壁磁磚或窗戶玻璃可能破損，書櫃可能倒塌」的程度。
據日本氣象廳消息，3日下午4點13分左右，十島村惡石島發生規模5.5地震，震源深度約20公里。雖然氣象廳表示無海嘯風險，但惡石島觀測到震度6弱的強烈搖晃，且地震是否會引發更大規模災害，以及網路謠傳將發生大地震，已引發當地居民及遊客的擔憂。
日本政府迅速應對，官房長官林芳正出面說明，並強調目前並無引發海嘯之虞，政府已啟動緊急應變機制，宣布將「官邸危機情報聯絡室」升格為「官邸對策室」，全力投入救災工作。林芳正也轉達總理石破茂下達的三項緊急指示，包括儘速掌握災情、與地方政府密切合作展開救援行動，以及即時向民眾傳達避難相關資訊。
熊本大學副教授橫瀨分析，過去群發地震主要由兩個斷層引起，但這次可能受到三個斷層的影響。由於網路流傳漫畫家龍樹諒的預言，指稱7月5日日本將發生大地震，引發民眾恐慌。對此，日本氣象廳已召開記者會澄清，強調十島村的地震與未來30年內發生機率高達80%的南海海槽巨大地震之間，沒有特別的關聯性。
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