日本運輸安全委員會，25日公布1月羽田撞機調查報告最新進度，其中海保機機長誤會塔台指令，是導致這起意外的原因之一。一位前機師指出，面臨時間緊迫的狀況，恐使海保機機長引發「心急症候群」，失去正確判斷力。
綜合《朝日新聞》與《產經新聞》報導，這起撞機意外發生在1月2日，海保機上載運100條毛毯和800人份的防災食品，準備從羽田前往新潟航空基地，協助能登半島地震救災。
海保機機長指出，卸下物資需要時間，考慮到返回羽田機場後機組員回家的方式，他當時設法盡量趕時間。但海保機出發前輔助動力裝置故障，出發時間晚了約40分鐘，最後在準備進行交叉口起飛（Intersection departure，不使用整條跑道，從跑道中間起飛）時發生意外。
報告指出，收到表示起飛順序第一的「No.1」指示時，海保機機長誤以為管制官安排他們優先起飛。而根據機艙內的錄音，當副機師複誦管制指示「前往C5待命點，JA722A, 起飛第一順位，謝謝（To holding point C5, JA722A, No.1 Thank you）」時，機長卻只複誦「No.1」和滑行道的「C5」。
