台灣目前證件上都以男、女區分性別，但為了保障雙性人及跨性別者的權益，最新消息指出，政府將比照國外在證件等相關文件另開設「第三性別」選項，初步研議，包括護照、戶政系統都優先開設，且外交部表示「護照可立即處理」。
據《上報》報導，行政院政務委員林萬億已要求各部會「在身分相關措施法規及文件上涉及性別的部分，以增列『第三個性別選項』為方向研議」，並要求行政院性別平等處，3個月內盤整各部會法令。
對此外交部表示，因世界各國已有第三性別選項，因此能夠馬上做到；內政部表示，增列第三性別欄位沒太大難度，只要醫療院所開立「證明第三性別」相關文件，戶政機關修改系統就可配合登記。另外身分證字號目前仍為男生是1、女生是2的編碼，未來也將設計第三性別的「性別碼」，使第三性別有專屬性別碼。
全球目前有8個國家在護照的性別欄上提供了「X」（unspecified，不指明）的選項，包括澳洲、紐西蘭、馬爾它、尼泊爾、 丹麥、印度、巴基斯坦和孟加拉。
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