宜蘭大學女教官因為參與倒扁遭到調職，現在傳出杜正勝對她不滿，決定改造教官體系，計畫將校園中的教官調回軍中，在立法院引發立委砲轟，痛批這是「教官滅絕計畫」，不過杜正勝否認，只強調教育部是配合國防部的政策。
立委李慶安：「(認為)教官不應該輕易退出校園的請舉手，校長們不要怕，部長你看看。」
半數以上的校長，舉手反對教官退出校園，當場給教育部長杜正勝難看。立委李慶華：「前女教官王逸蓁他參加(倒扁)活動，你更火大，於是計畫把教官處理掉。」教育部長杜正勝：「不是的，我們是不可能作這種事。」
杜正勝強調，教官整頓政策，是配合國防部計畫，加上學務工作盤整，絕對無關個人私怨。李慶華：「有一個軍訓教官滅絕計畫。」杜正勝：「我們是採取他自然退休。」 立委郭素春：「那他們叫什麼？自我了斷或是自我凋零計畫！」
對於教官整頓，杜正勝很有定見，但一被問到要不要和李遠哲一樣跳出來，杜正勝就開始打太極。李慶華：「你贊成李遠哲的呼籲嗎？」杜正勝：「李遠哲前院長，他現在是『一介平民』嘛。」郭素春：「我覺得你也很沒感情嘛，哪有一個部長在一個中研院長，才剛下來2個月，就說他是『一介平民』。」
為了強調自己的身分不適合發表言論，杜正勝說李遠哲是「一介平民」當然被叮得滿頭包，至於對陳總統的看法，得等到他認為適當的時機、地點、身分，才會表態。
