為了讓年底投票順利舉行，行政院想了很多折衷方案，要說服泛藍執政縣市支持一階段，其中包括公投跟立委選票分2個桌子領，用意是保護投票的人不會暴露投票意向，也讓動線順暢；只不過，台北市選委會還是認為投票所大小不一，如果只有小小10坪，不管你領不領，還是會被人看到，哪算有符合「秘密投票原則」。
搭起鋼架、裝起圈票簾，投票當天，每個投票所都將如此佈置，不過看看領票處這裡，卻是有2張桌子，這就是行政院提出的折衷方案，讓立委票跟公投票分開來領。
TVBS記者許甫：「由行政院及中選會，提出的一階段投票方式，我們先要在第一個桌位，領取立委的選票，以及一張政黨的選票，接著走向第二張桌位，如果你不領取公投票的話，直接到圈票處圈選，如果我要領公投票的話，這時候我要到第二張桌子，但在這麼狹窄的空間裡，如果我要領國民黨版，或是民進黨版的選票，這時候很可能，就會讓後面的人知道我的投票意向。」
行政院與中選會提出的一階段，先到第一張桌領立委和政黨票，想要領公投票，再到第二張桌，只是在狹小空間中，要領國民黨版或是民進黨黨版公投票，很可能被其他選民知道投票意向。
10坪左右的空間，到時候會配置大約15個選務人員，行政院原本認為這樣的動線，可以讓堅持兩階段投票的泛藍縣市安心，一階段領票不會亂，也不會暴露投票意向，不過台北市選委會，就很質疑。
台北市選委會副總幹事黃細民：「當你表明我要領哪一張票，旁邊和排隊的人，都會聽得到，但是中選會的講法，又是這樣是比較秘密性投票，我們是感到好像跟實際的操作面，是不一樣的。」
國民黨版的兩階段，選民先到第一張桌子領立委政黨2張票，走到圈票處圈選，投入2個票匭，接著領取第二階段的公投票，圈選蓋戳記，再投入票匭，在藍軍還有疑慮的情況下，政院還能提出什麼新方案，才能讓堅持兩階段的藍軍執政縣市點頭，中選會還有得傷腦筋。
