立法院正副院長選舉結束，綠白兩陣營卻對「喬院長」一事隔空交火，民眾黨宣稱綠營中間人在1月31日聯繫黨主席柯文哲，民進黨發言人吳崢強調是柯文哲主動致電，這位醫界大老願意出庭作證。對此，柯文哲昨（2）日深夜還原事件始末，表示民進黨高層透過中間人到他辦公室，「請我聯絡可以代表賴清德副總統的陳永興醫師」，雙方僅短暫交談，並非他主動提出交換條件，下週會採取正式法律行動，以訟止謗。
柯文哲在臉書發文指出，藍、綠都有許多人居間穿梭，希望爭取民眾黨的支持，他秉持善意、以禮相待，投票前一天晚上，「民進黨高層透過中間人來我辦公室，告訴我民進黨考慮院長投給黃珊珊，請我聯絡可以代表賴清德副總統的陳永興醫師，中間人並且在我辦公室用她的電話打給陳醫生」，兩人確實有談話，幾個小時後中間人打來但他都沒有接到，對方就傳陳永興的電話請他回電，「陳永興醫師今天的聲明稿，不知是他本人不知道還有前面這段，還是直接省略，只說他接到柯文哲電話，使外界以為是柯文哲主動去提交換條件。」
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柯文哲提到，1月31日晚上10時，緊急召開黨團線上會議，將民進黨「院長願投黃珊珊，民眾黨副院長支持蔡其昌」的提案交由黨團立委討論，大家最終仍決議自推人選，他也把結果傳達給陳永興，得到的回覆是「我們已盡力了，就交給上帝吧！祈願神能賜福臺灣有一個健康的國會」。
對於陳永興及民進黨奔走的人士，柯文哲表達感謝之意，不過強調完全無法認同放話、扭曲事實的歪風橫行，「此一事件顯示民進黨在立法院長選舉一局派系鬥爭 ，斧鑿斑斑，有人為迴避敗選責任，誤導大眾、甚至侵害他人名譽也在所不惜。」他除了提告之外，更無法容忍民進黨高層長年利用媒體作為政治鬥爭工具，造謠亂政的行為，「我不坐視民進黨敗壞社會風氣，才可能正本清源，達成政黨合作、社會和諧的終極目標。」
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