醫福會執行長王必勝20日深夜，偕同農委會副主委找台北市副市長黃珊珊到北農關心疫情，引發外界聯想，中央要接管北農嗎，不過，21日黃珊珊出面強調北市作為，也提到北農為什麼難以休市，似乎在跟中央抗衡。
民進黨北市議員許淑華：「(北市府)犯了4個嚴重的錯誤，第一個沒有擴大匡列對象，第二個沒有強制快篩，第三個沒有勒令停業，第四個沒有具體防護措施。」
民進黨議員接連砲轟北市府，認為北農群聚感染可以避免，攤開決策過程，一開始5月2日員工爆發確診，北農當時採取防疫措施，分區分時段分散人流，擴大交易空間-預約制交易，加強場內消毒，但外界也有休市聲浪，卻被台北市市場處否決，他們認為，攸關大台北民生物資，不宜休市，到了6月18日擴大到18人確診，19日北市府啟動北農2.0專案，進駐快篩，但感染持續擴大到45人確診，6/21王必勝協同農委會關心，現在不休市決定也被質疑。
北農董事長黃向羣：「工會有個別意見，他們會認為說他們把一年休息日把60天，休息到67天，北農必須要衡量休市的狀況，調配進貨的數量。」
台北市副市長黃珊珊：「批發的很難停業啦，批發的一市這邊的批發市場問題不大，是一市這邊裡面的市場有攤商確診，要去處理。」
強調考慮到蔬菜供貨以及各方意見，現在還傳出當時中央早就想要進駐快篩，但北市不理不睬，也說疫調是中央責任。
民進黨北市議員簡舒培：「北農位於台北市，台北市政府擁有衛生主管機關的疫調權力跟責任。」
北市議員砲轟市府，痛批柯文哲甩鍋，北農案件再度挑戰柯文哲決策能力。
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