台鐵2009年招標ATP的遠端監視系統，聲稱在2010年已經加裝所有列車，沒想到卻獨漏普悠瑪，從決標資料查出當時得標的廠商是位在信義區的三商電腦，以1800萬元的價格得標，而且當時僅有他一家投標，但關於採購細節、規格、數量，三商沒有回應，台鐵局內部也表示沒有對外公開。
翻開民國94年，台鐵局人員遠赴瑞典考察資料，ATP本身並沒有監控系統，因此2009年才對外招標，然而當時，只有三商電腦一家競標，而且順利得標，台鐵宣稱在2010年已經完成779班列車ATP監控系統，駕駛只要開啟或關閉ATP，訊號都會透過無線電告知調度員，但這說法遭到打臉。
時代力量立委黃國昌：「台鐵告訴全體人民的理由是，普悠瑪根本沒有辦法裝，這不是開大家玩笑嗎。」
台鐵一度聲稱採購監視系統，是2009年7月，因此在2013年引進的普悠2000型時間晚了四年，沒有裝到，但專家不這麼認為。
資安專家陳亮宏：「如果一樣傳回行控中心，跟傳電腦一樣，一個是傳到車上，一個是傳到行控中心，理論上是可以做到這一點。」
專家以技術層面來說，訊號傳輸不論新舊都能調整，也就是其實追加預算，就能替普悠瑪裝監視系統，再加上2013年12月，台鐵最新型的EMU800型電聯車，上頭卻裝有遠端監視系統，台鐵就發新聞稿改口，普悠瑪沒裝詳細原因還要再調查。
從25日中午一點，一直到晚間超過6個小時，三商電腦沒有回應，但台鐵內部人士透漏決標詳細內容，沒有對外公開，採購型號、數量、細節無從得知，然而台鐵局長鹿潔身忙著下台，以辭謝罪，後續該攤開的真相，從處理態度就顯得台鐵內部一團混亂。
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