醫師規劃2019年全面納入勞基法，不過衛福部醫師每週工時與勞動部喬不攏，計畫恐跳票，衛福部醫事司長石崇良接受訪問時說，醫療有特殊性，勞動部目前不接受衛福部擬定的每週工時80小時、連續工作最長28小時，因此決議先修醫療法保障醫師勞動權益，卻遭到醫勞團體強烈反對，認為是走回頭路，無法解決過勞問題。
護理師每隔一段時間就要照顧患者，另一邊的住院醫師一下看病歷，一下還要關心病人的狀況，衛福部原本計畫2019年9月受雇醫師全面納勞基法，但衛福部日前表示醫師每週工時，和勞動部還沒達成共識。
台北市醫師職業工會發起人黃致翰：「不讓醫師納入勞基法，而且提出要用醫療法的規範，這是一個非常不尊重專業的一個行為，因為勞動的規範、勞動法令的規範，還有勞動條件的一個保護，還有勞動檢查，這都是一個非常專門的事情。」
醫事司長石崇良說醫療有特殊性，目前適用勞基法84條之1議定工時的勞工中，每週工時最高的為保全業72小時，還是比住院醫師80小時低，住院醫師值班連續工作工時最低已壓到28小時，但勞基法規定最高只能12小時，因此衛福部決議先修醫療法，保障醫師勞動權益。
醫改會副執行長朱顯光：「有些中小型醫院也不像醫學中心人力那麼足，是不是可以慢慢地讓他的工時，也可以慢慢做一些更彈性的下降，我覺得應該是回到這樣子，而不是說我今天是鐵板一塊，就算2年後上路我還是一樣，每週工時80小時，連續值班28小時不肯改，如果我還是堅持這樣子的話，為什麼要拖到2年後才實施，為什麼不現在就實施。」
醫護用責任感繼續撐，過勞問題仍然不會改善，舉例來說有些值班醫生整晚睡不到1小時，隔天又要繼續上班，對自己和對病患都有不好的影響，加上勞動部有勞檢人員衛福部卻沒有，無法稽查工時確保減少過勞的問題。
台北市醫師職業工會發起人黃致翰：「衛福部本身第一個沒有這樣子的人力，沒有這樣子的預算，更不用說沒有這樣子的勞動檢查的經驗，所以就算醫生表面上有一個醫療法來保障工時方面的問題，可是事實上可能會淪為評鑑，大家都知道很多都是紙上作業，事實上根本沒有達到，效果一定不會像納入勞基法這樣子的好，真正保障到醫師和病人的權益。」
根據統計醫師若納入勞基法，醫療院所將出現高達2000人力缺口，醫院被迫關床或休診，最終將會醫病雙輸，醫改會也駁斥這種說法。
醫改會副執行長朱顯光：「醫師有一個合理的工時，國外早就行之有年，這應該也是會用一些輪班，或是合理的我們叫做團隊照護，英文叫做share care的方式，其實絕對不可能有醫師開到一半，病人就丟在那裡，我覺得不要用那樣來恐嚇關床來恐嚇。」
衛福部信誓旦旦，要將醫師納入勞基法，但醫勞團體就怕醫療法會成為財團法人醫院的靠山，繼續壓榨醫師。
衛福部醫事司長石崇良：「我們就是在108年9月，將這個受僱醫師納入勞基法，這個目標是沒有改變，最大的落差還是在因為醫療的特殊性的關係，還有就是住院醫師訓練的需要，所以在工時的部分，的確在跟其他的行業別有相當的差異性，所以在這個部分還要再進行溝通。」
同時為了讓108年醫師全面納入勞基法，衛福部也推出住院醫師勞動權益保障及工作指引，來讓醫院在過渡期逐步適應。
衛福部醫事司長石崇良：「其他譬如說在這個人力的調度上，特別是在偏遠地區，那麼可能會面臨到值班的人力可能會更吃緊，這些我們都會有一些相關的配套，那麼必須一步一步的去規劃。」
醫師納入勞基法議題討論多年，公部門也花了許多預算去推行，為了讓醫療資源永續，民眾必須先翻轉就醫觀念，落實醫療分級，才能加速改善醫療環境。
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