衛福部大規模抽驗市售油品是否有添加銅葉綠素，雖然是為民眾把關，不但測出的結果引來一些業者反彈，連檢驗的方法也有不少學者提出質疑，因為目前是以「大統油品」做為銅葉綠素的添加基準，只要檢驗訊號是一樣的油品，衛福部就認定有添加銅葉綠素，但問題是，葉綠素有許多種類，如果有的油品商採用不同的葉綠素，檢驗訊號就不一樣，即使添加了銅也查不出來，學者更直言，既然銅葉綠素是可以添加的，那為什麼不直接驗「銅」的含量有無超標，才是問題的核心呢？
在義大利的莊園裡，農民收成橄欖後，就在自家的小廠房裡直接取油，手續其實簡單，先洗乾淨，不去籽，直接壓成汁，再把油分開濾出來，比較一下，初榨出來的橄欖油是偏黃，甚至帶點土色，而大統的橄欖油偏綠，就是添加銅葉綠素的結果，衛福部進行的檢測方法是，以大統葉綠素的原料，和大統的油品，當做檢驗基準，跟市售的油品做比對，如果出現相同訊號，表示檢測的油品添加銅葉綠素，如果訊號不同，就是沒添加，但這套標準，卻受到學界質疑。
因為銅葉綠素，其實是含銅的葉綠素，但葉綠素在大自然有許多種類，例如a、b、d，假設大統用的是葉綠素a，但其他廠牌用的是葉綠素b或d，那麼比對結果不同，反而忽略有沒有超標添加銅的問題。
淡大化學系教授李世元：「資料庫要建立才會準確，不然的話現在只針對單一葉綠素，你就說它存在不存在，我想誤差產生的可能性是比較高。」
學界普遍質疑的是，其實銅葉綠素是可以添加的，只是銅不能超標，但衛福部目前公布的流程沒辦法檢出銅是否過量，另外油品業者泰山也喊冤，認為台灣FDA沒有告知國內外業者，如何萃取銅葉綠素方法，標準更沒有和國際一致，讓進口商無所適從。
對此衛福部反擊，強調目前國內外都沒有驗銅葉綠素的統一準標，FDA是取樣從大統長基沒收的銅葉綠素，以及市面上販售共2、3種樣本，純化成為對照組，並且徵詢國內外學者意見，檢驗方式絕對謹慎可靠，況且每各國家都有各自對銅葉綠素的檢驗標準，應該是業者要來符合國內法規，而並非衛福部去適應他國標準，只是銅葉綠素檢驗是台灣有史一來第一次，前無法規又沒有參考標準，才會讓學界業者質疑聲不斷。
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