藥師人力過度飽和引發產業危機，台灣藥師人數已達每萬人口十三人，遠高於經濟合作暨發展組織（OECD）國家平均的八點六人。近十二年來，國防醫學院藥學系招生名額從十人大幅增加至二十八人，使藥學系學生總數超過政府承諾的一千一百四十八人上限。基層藥師協會與藥師公會全聯會對此表達強烈關切，警告若不妥善控管藥師人力，恐將如日本般出現「流浪藥師」現象，影響醫療品質與民眾健康。
社區藥局藥師是民眾常接觸的醫療人員，負責調劑處方、提供用藥衛教及傷口敷料使用指導等服務。然而，獨立社區藥局目前面臨經營困境，除了連鎖藥局擴張的壓力外，藥師人力過度飽和也是關鍵問題。基層藥師協會理事長沈采穎指出，藥師人力控管機制僅為默契，並無明文規定，教育部有時不按牌理出牌。她提到，立委柯建銘曾在一百一十一年答應藥師公會全聯會，要求教育部針對各校藥學系進行評比，依師資設備狀況決定是否減招或調整名額。
藥師公會全聯會理事長黃金舜表示，公會希望藥學系招生總額限制在一千一百四十八名，但教育部明確表示國防大學招生不歸其管轄，因此未包含在此限制內。黃金舜強調，公會希望國防增加藥學系招生應與藥師公會溝通協調，若提出正當理由則予以尊重，否則將提出不同看法。他提醒，國防藥學系如果沒有適切的理由就增額，將破壞藥師人力市場，造成過度競爭，對民眾不利。
沈采穎引用日本案例，指出日本藥師人力在OECD國家中比例最高，因此在二○二三年停止設置新藥學系或增加招生名額，並預估到二○四五年可能會有十二萬六千名流浪藥師。她質疑教育部為何不汲取國外經驗，檢討台灣藥學系過度擴張的問題，並主張醫學系、藥學系及牙醫系名額應嚴格控管甚至立法規範，因為這關係到人民生命健康。
而之前教育部在6月同意清華、中興、中山等三所大學的學士後醫學系，從公費生改為自費一般生，招生名額也從原本的23名調增為35名。同時，還將國防醫學系排除在總量管制之外，這項決策引起醫界強烈反彈，質疑是繞道招生。對
此，衛福部與教育部後來召開會議討論，達成共識，強調醫學系學生的招生總名額仍維持原本的1300名，不會改變。
新光醫院副院長洪子仁認為，醫師人力問題主要在於城鄉分布不均與科別不均，而非總量不足。他表示，討論增加醫師容額時，必須考慮訓練師資是否充足以及國家未來五至十年的發展規劃。洪子仁引用韓國案例，指出韓國去年大幅擴招醫學生導致醫師大罷工，至今餘波蕩漾。他強調，台灣應優先提高急重症科別、兒科、感染科等高風險科別的健保給付，改善工作環境，否則即使廣開醫學系大門，年輕醫師也會流向醫美整形等科別，最終損害台灣醫療品質，增加死亡率。
